含有分支机构的公司想要退市，先注销分支机构，再注销总公司，这样才是正确的顺序。
再来介绍一下公司注销的基本流程：

1、准备营业执照正副本原件、法人身份证复印件、公司印章，公司历年来的记账凭证、财务报表以及工商年报、税务年检等其它资料。

2、公司资产清算。
成立清算小组做清算公告，并通知相应的债权人，公告结束后对公司资产、债务等情况进行清算。

3、公司税务注销。
需向税务机关结清应纳税款、滞纳金、罚款及缴销发票，若公司税务存在异常则先解除才能办理注销。

4、公司工商注销。
清算报告经股东会、股东大会或人民法院确认后，到登记机关注销营业执照，若存在工商异常，也需解除后再办理工商注销。

5、注销公司社保账户、银行对公账户，注销公司公章。